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Topoisomerase I (Vaccinia virus)

簡要描述:

Topoisomerase I (Vaccinia virus)公司正在出售的產(chǎn)品:人胃腸間質瘤細胞 微管相關蛋白封閉多肽 疏螺旋體PCR檢測試劑盒 大鼠腦鈉/腦鈉尿肽(BNP)ELISA檢測試劑盒 果膠甲酯化程度活性比色法檢測試劑盒 太平洋硫膨大桿菌 環(huán)指蛋白34抗體

更新時間:2025-07-03

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Topoisomerase I (Vaccinia virus)

公司產(chǎn)品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!

貨號

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

A-Hc2235

Topoisomerase I (Vaccinia virus)

100U

描述:

該 Topoisomerase I 來源于牛痘病毒(vaccinia virus),通過基因重組方案制備純化。其能解旋DNA的超螺旋結構,除此外其能識別并切割雙鏈 DNA 末端 [5’C(T)CCTT↓],并且與 DNA 形成共價連接形成穩(wěn)定復合物。該共價復合物遇到DNA 的5’-OH基團后,重新連接形成完整 DNA 鏈。因此,使用該酶可作為 DNA 連接的有效工具,可用于 DNA 的載體連接(TOPO 克隆載體制備)、接頭連接(NGS 建庫)等實驗。

應用
DNA-載體連接
接頭連接
儲存:-20°C 可保存 3 年。
TOPO 酶保存液:20mM Tris-HCl,pH7.8,150mM NaCl,
0.1% Tween20,50%甘油。
反應實例 1(質粒解旋)
10×TOPO Buffer 2.5 μl
超螺旋質粒 DNA 1-20 μg
Vaccinia TOPO (5pmol/μl) 1 μl
ddH2O Up to 25 ul
37°C 孵育 5-15min。
反應實例 2(接頭連接)
10×TOPO Buffer 2.5 μl
2 M NaCl 2.5 μl
接頭 A(含 CCCTT) 5-100 pmol
接頭 B(含 5‘OH) 5-100 pmol
Vaccinia TOPO (5pmol/μl) 1 μl
ddH2O Up to 25 ul
37°C 孵育 5-15min。
注意:(1)雙鏈接頭 A 通常 5’做 NH2 封閉修飾,以防止自連接;接頭 A 的 CCCTT 后通常包含 5-12bp 尾巴,再長的尾巴會導致連接效率大幅下降;
(2)雙鏈接頭 B 的 5’端必須包含-OH。
(3)由于該酶應用廣泛,在不同的實驗中使用策略不同,需要靈活運用。該類實驗請根據(jù)文獻)進行調整。

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PCR 反應需要使用哪些試劑和設備?

試劑:
模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節(jié)反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產(chǎn)物;
設備:
PCR儀:用于控制反應溫度,保證PCR反應時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產(chǎn)物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。  這些試劑和設備在PCR分子生物學技術中均是,只有在有序齊全的基礎上,才能進行PCR反應并得出準確結果。

PCR相關基礎實驗:

PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:

一、變性:

利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。

二、退火或稱接合,復性:

在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結合或者錯誤地結合。該步驟時間1-2分鐘。

三、延伸:

DNA聚合酶由降溫時結合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。

PCR反應條件優(yōu)化:

1、變性溫度和時間:

保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。

2、復性溫度和時間:

PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結合。復性溫度越高,產(chǎn)物特異性越高。復性溫度越低,產(chǎn)物特異性越低。需根據(jù)引物的Tm值具體設定。

3、延伸溫度和時間:

一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間,可根據(jù)待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設置恰到好處的延伸時間。

4、循環(huán)數(shù):

其他參數(shù)選定后,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后,PCR產(chǎn)物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應的產(chǎn)率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多,非特異擴增增加。

公司正在出售的產(chǎn)品:

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